電子実験ノート(ELN)と紙の違いを徹底比較｜研究DXを加速させる【2025年版】

研究記録の管理は、日々の研究活動において非常に重要な業務です。
しかし、従来の紙の実験ノートでの管理に、何らかの課題を感じている方も多いのではないでしょうか。

• 過去の実験データを探すのに時間がかかる
• チーム内での情報共有がスムーズにいかない
• 増え続けるノートの保管場所に困っている
• ノートの紛失や劣化、研究者の退官・退職に伴うやむを得ないノートの廃棄

上記のようなお悩みは、研究者であれば一度は経験したことがあるかもしれません。
こうした課題を解決する手段として、近年「電子実験ノート（ELN）」が注目されています。
一方で、導入にはコストや操作性の習熟、データの信頼性など、新たな不安が伴うのも事実です。

この記事では、長年研究の現場で使われてきた「紙のノート」と、新しい研究スタイルを提案する「電子実験ノート」を徹底的に比較します。
それぞれのメリット・デメリットを深く理解し、あなたの研究室や組織にとって最適な選択をするための一助となれば幸いです。

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そもそも電子実験ノート（ELN）とは？紙との根本的な違い

電子実験ノート（Electronic Lab Notebook、略してELN）とは、その名の通り、実験の内容や結果、考察などを電子的に記録・管理するためのシステムです。
単に手書きのノートをパソコン入力に置き換えただけのものではありません。

ELNの本質は、テキスト、数値データ、画像、関連ファイルなど、研究に関するあらゆる情報を一元的に集約し、それらを「資産」として活用することにあります。
紙のノートが個人の「記録」にとどまりがちなのに対し、ELNはチーム全体の「共有知識ベース」として機能する点が、最も大きな違いと言えるでしょう。

電子実験ノート(ELN) vs 紙のノート どちらを選ぶべきか【10項目で徹底比較】

それでは、具体的に電子実験ノートと紙のノートは、どのような違いがあるのでしょうか。
ここでは、研究者が記録管理において重視する10つの観点から、両者のメリット・デメリットを詳しく比較していきます。
ご自身の研究環境や現在抱えている課題と照らし合わせながら、読み進めてみてください。

比較項目	紙の実験ノート	電子実験ノート（ELN）
① 記録フォーマット	△ 自由度が高いが属人化	◎ 統一・標準化しやすい
② データ管理	× 物理保管・紛失リスク	◎ 一元管理・バックアップ
③ 検索性	× 手作業で探すのみ	◎ 瞬時に検索可能
④ 共有性	△ 物理的な受け渡しが必要	◎ リアルタイム共有・共同編集
⑤ セキュリティ	× 紛失・盗難リスク	◎ 多層的な保護が可能
⑥ 法規制対応	× 手作業で負担大	◎ 機能による効率化
⑦ コスト	○ 初期費用は安い	△ システム費用がかかる
⑧ 導入の容易さ	◎ すぐに利用可能	△ トレーニングが必要
⑨ 長期保存性	△ 経年劣化は不可避	◎ 半永久的に保存可能
⑩ 試薬への耐性	◎ 汚れても使用可能、物理的損傷に強い	✕ 溶解・破損のリスクあり

① 記録フォーマット：手書きの自由度 vs デジタルの統一性

紙のノート最大の魅力は、手書きならではの自由度の高さです。
思いついたアイデアをスケッチしたり、図や表を直感的に書き加えたりと、思考を止めずに記録できます。
しかし、その自由さが裏目に出ることもあります。
記録のスタイルが研究者ごとに異なり、第三者が見たときに内容を正確に理解するのが難しい、といった属人化の課題を生みやすいのです。

一方、電子実験ノートはテンプレート機能を使うことで、記録フォーマットをチーム全体で統一できます。
実験プロトコルごとに決まった様式で記録を残せるため、誰が書いても情報の均質性が保たれ、データの比較や解釈が容易になります。

② データ管理：物理的保管のリスク vs クラウドでの一元管理

紙のノートは、物理的な保管スペースを必要とします。
研究室の棚が増え続けるノートで埋め尽くされている、という光景も珍しくありません。
また、水濡れや火災による破損、紛失といった物理的なリスクは常につきまといます。

これに対し、電子実験ノートはすべてのデータをサーバーやクラウド上で一元管理します。
Amazon S3やMicrosoft Azureといった信頼性の高いクラウドストレージを利用すれば、自動バックアップによって災害時にもデータを安全に保護できます。
バージョン管理機能により、誤ってデータを変更・削除してしまっても、過去の状態に復元することが可能です。

③ 検索性：手作業の限界 vs 瞬時に見つかる電子検索

「あの実験データ、どのノートに書いたかな…」と、何冊ものノートをめくって探した経験はありませんか。
紙のノートでは、過去の記録を探すのは完全に手作業であり、膨大な時間と労力がかかります。

電子実験ノートの強力な検索機能は、この課題を根本から解決します。
キーワードや日付、実験条件などを指定するだけで、関連する情報を瞬時に探し出すことができます。
これにより、過去の膨大なデータは「眠っている記録」から「いつでも引き出せる資産」へと変わり、無駄な追試の回避や新たな知見の発見につながります。

④ 共有性：物理的な受け渡し vs リアルタイムでの共同編集

共同研究において、紙のノートでの情報共有は非効率になりがちです。
ノートを直接受け渡すか、必要なページをスキャンしてメールで送るなど、時間と手間がかかります。

電子実験ノートは、ネットワークを通じてリアルタイムでの情報共有を可能にします。
チームメンバーが同時に同じノートを閲覧・編集できるため、共同研究のコミュニケーションが飛躍的に円滑化します。
もちろん、アクセス権限を細かく設定できるため、機密情報を守りながら必要なメンバーとだけ情報を共有することも可能です。

⑤ セキュリティ：紛失・盗難リスク vs デジタルでの堅牢な保護

紙のノートは、研究室からの持ち出しによる紛失や盗難、第三者による不正な閲覧のリスクが常に存在します。
一度失われると、取り返しがつきません。

電子実験ノートは、多層的なセキュリティ機能によって研究という知的財産を堅牢に保護します。

セキュリティ機能	概要
アクセス制御	ユーザーごとに閲覧・編集権限を設定し、不正なアクセスを防ぐ。
暗号化	通信経路や保存データを暗号化（AES-256など）し、データの盗聴や改ざんを防止する。
監査証跡	「誰が」「いつ」「何を」変更したかの記録をすべて自動で残し、不正な操作を追跡可能にする。
二段階認証	パスワードに加えて、スマートフォンなどを用いた追加認証で本人確認を強化する。

これらの機能により、紙媒体とは比較にならない高いレベルでのセキュリティが実現できます。

⑥ 法規制対応：手作業の負担 vs 自動化によるコンプライアンス強化

研究記録は、特許出願や外部機関への申請時に、その正当性や信頼性を示す重要な証拠となります。
特に記録の整合性や追跡性が求められる分野では、日付の記入や修正履歴の管理など、紙のノートでは多くの手間と注意が必要です。

電子実験ノートであれば、タイムスタンプや変更履歴の自動記録により、こうした手続きを効率化できます。
記録の完全性をシステムが担保することで、研究者は煩雑な管理作業から解放され、監査や申請対応にもスムーズに対応できる環境を実現します。

⑦ コスト：見えにくい間接コスト vs 明確なシステム費用

一見すると、紙のノートは1冊数百円からと非常に安価です。
しかし、長期的に見ると、ノート代だけでなく、保管キャビネットやスペースの賃料、そして何より「記録を探す時間」という膨大な人件費（間接コスト）が積み重なっていきます。

一方で、電子実験ノートはソフトウェアの導入費用や利用料といった直接的なコストがかかります。
しかし、これらは記録管理業務の効率化によって削減される間接コストを考慮すれば、長期的には十分に相殺され得ます。

コスト構成の比較（イメージ）

費用項目	紙の実験ノート	電子実験ノート（例：クラウド）
初期導入費用	ほぼ不要	ソフトウェア導入費用が必要
保管・スペース費用	キャビネット・保管場所が必須	基本的に不要
運用・検索コスト	記録を探すための人件費が発生	検索機能により大幅に削減可能
長期的な総所有コスト（TCO）	表面的には安価だが隠れコストが蓄積	導入費用はあるが効率化で相殺可能

⑧ 導入の容易さ：即時利用 vs 計画的なトレーニング

紙のノートに、特別なトレーニングは必要ありません。
誰でも購入したその日からすぐに利用を開始できる手軽さは、大きなメリットです。

一方、電子実験ノートの導入には、ソフトウェアの操作方法を学ぶためのトレーニングや、既存の紙ノートからのデータ移行など、ある程度の計画的な準備期間が必要です。
この導入時のハードルはデメリットと捉えられがちですが、この手間を乗り越えることで、将来にわたる研究活動の効率化という大きな果実を得ることができます。

⑨ 長期保存性：物理的劣化 vs デジタルデータの永続性

紙の実験ノートは、時間と共に避けられない物理的な劣化に直面します。
紙は黄ばみ、インクは褪色し、長年の間に脆くなってしまいます。
適切な温湿度管理がされた環境でなければ、情報の完全な保存は困難です。

電子実験ノートは、電子データとして存在するため、物理的な劣化がありません。
定期的なバックアップと、将来のファイル形式に対応するためのデータ移行管理を適切に行えば、情報を半永久的に、作成当時の品質のまま保存し続けることが可能です。

⑩ 試薬への耐性：紙の物理的強さ vs 電子機器の脆弱性

実験室という特殊な環境では、「試薬に対する耐性」も無視できない比較軸です。

紙のノートは、多少の試薬の飛散や汚れがあっても記録自体を読み取れなくなることは少なく、拭き取ったりコピーしたりすることで対応可能です。耐酸性や耐水性のある特殊な紙を選べば、さらに強靭さが増し、長期間の利用にも耐えられます。

一方、電子実験ノートを利用するパソコンやタブレットは、試薬が垂れると深刻なダメージを受ける可能性があります。実際に、強い酸や有機溶媒でパソコンの筐体が溶け、穴があいてしまった事例も報告されています。機器の故障は記録の損失や研究活動の停滞につながるため、現場では依然として紙が重宝される大きな理由の一つです。

そのため近年では、紙と電子のハイブリッド運用が注目されています。
紙は「現場での即時性と物理的な強さ」を担い、電子は「検索性・共有性・保存性」を担う。両者をうまく組み合わせることで、研究活動に最適な環境を構築することができます。

電子実験ノート(ELN)の導入時に感じやすい“ギャップ”とその解決策

紙から電子への移行は、単なるツールの変更以上のインパクトがあります。
多くの研究者が、そのメリットを理解しつつも、いくつかの“ギャップ”や“壁”を感じることがあります。
ここでは、代表的なギャップとその乗り越え方について解説します。

UIへの慣れ・入力の手間

これまでペンで自由に書き込んできた研究者にとって、キーボードでの入力やマウス操作は煩わしく感じられることがあります。
特に、化学構造式や複雑な図を描画する際には、手書きのスピード感に敵わないと感じる方も少なくありません。

そのため、電子実験ノートを導入する際には、「入力操作にどれだけ直感的に馴染めるか」 が大きなポイントとなります。
直感的に使えるUIや日本語環境に最適化された設計であれば、従来の紙のノートからの移行もスムーズになりやすいのです。

「紙の感覚」との乖離

実験台の脇にノートを広げ、気づいたことをすぐにメモする。
この「紙のノートがある日常」の感覚が失われることに、寂しさや不安を感じる研究者もいます。
このギャップを埋めるには、ELNを「記録ツール」としてだけでなく、「思考ツール」として活用できる製品を選ぶことが重要です。
例えば、手書きメモをそのまま画像として貼り付け、後からテキストで補足説明を加えるといった使い方ができると、紙の良さを活かしながら電子化のメリットを享受できます。

記録文化の変化に対する戸惑い

ELNの導入は、個人の記録スタイルからチームで共有する記録文化への転換を促します。
これまで個人の裁量に任されていた記録の取り方が標準化されることに、窮屈さを感じる人もいるかもしれません。
これを乗り越えるためには、トップダウンでの導入決定だけでなく、なぜ電子化するのか、それによってチーム全体にどのようなメリットがあるのかを丁寧に説明し、コンセンサスを形成するプロセスが不可欠です。

電子実験ノート(ELN)導入は段階的でもOK｜ハイブリッド運用という選択肢

いきなり全ての実験記録を電子化することに抵抗がある場合、無理に一斉導入する必要はありません。
紙の良さと電子の利便性を組み合わせた「ハイブリッド運用」から始めるのも、賢い選択です。

紙＋画像アップロードから始める方法

まずは、これまで通り紙のノートに記録をつけ、そのページをスマートフォンのカメラやスキャナで撮影・スキャンします。
その画像データをELNにアップロードし、日付やキーワード、簡単な説明文を付けて保存するのです。
これだけでも、記録の検索性や共有性は格段に向上し、物理的な紛失リスクも低減できます。

まずは1研究室・1プロジェクト単位でテスト導入

組織全体での導入が難しい場合は、特定の研究室や単一のプロジェクトで試験的にELNを導入してみるのがおすすめです。
スモールスタートで成功事例を作ることで、操作に慣れるとともに、自組織に合った運用方法やルールを見つけ出すことができます。
その成功体験が、他の部署やチームへ展開する際の強力な説得材料になります。

Jikken Noteのような“導入のハードルが低い製品”の活用

最近のELNの中には、紙からの移行を強く意識し、導入のハードルを低くする工夫が凝らされた製品も登場しています。
例えば、弊社の「Jikken Note」は、手書き文字のOCR（光学的文字認識）機能を搭載しており、過去の紙ノートをスキャンして取り込むだけで、手書きの文字まで含めて検索対象にすることが可能です。
こうしたツールを活用することで、よりスムーズに電子化への第一歩を踏み出すことができます。

電子実験ノート(ELN)の本質的な違いは「資産化できる記録」である｜まとめ

ここまで、電子実験ノートと紙のノートを様々な角度から比較してきました。
両者の違いは、単なる媒体の違いではありません。
それは、「研究記録を未来への投資（資産）と捉えるか、過去の業務（コスト）と捉えるか」という、思想そのものの違いと言えるでしょう。

記録の活用性（検索・共有・継承）を最大化できる

ELNを導入することで、研究記録は検索・共有・再利用が容易な「生きたデータ」に変わります。
過去の成功も失敗もすべてがナレッジベースに蓄積され、組織全体の研究開発力を底上げします。
異動や退職があっても、貴重な知的財産が失われることなく、次の世代へとスムーズに継承されていくのです。

「誰が」「いつ」「何を」やったかを確実に残せる

ELNが自動で記録する監査証跡は、研究の信頼性と再現性を担保する上で不可欠です。
「誰が、いつ、どのようなデータを記録し、変更したか」が客観的な事実として残り続けるため、特許申請や査察対応においても強力な証拠能力を発揮します。
これにより、研究者は安心して研究に打ち込むことができます。

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